Артем Касьянов: "Как собрать геном из миллиарда кусочков? Компьютеры и современная биология."

Опубликовано 3 марта 2015, 23:09

Лекция Артема Сергеевича Касьянова прочитана в Популярном лектории "Архэ" (arhe.msk.ru) 24 января 2015 года.

Лектор - Касьянов Артем Сергеевич, научный сотрудник Лаборатории системной биологии и вычислительной генетики ИОГен РАН, кандидат физико-математических наук.

Информация о строении живых организмов записана в геноме — совокупности молекул ДНК, содержащихся во всех клетках живого организма. До недавнего времени прочтение генома было очень сложной и дорогостоящей задачей. Проект «Геном человека» длился более 10 лет и потребовал свыше 1 млрд. долларов. Современные технологии позволили сократить сроки (теперь не больше года) и стоимость подобных проектов. Значительную роль в столь стремительном развитии технологий секвенирования сыграли информационные технологии. Без наличия специальных алгоритмов реконструкция геномных последовательностей была бы невозможна.
Из лекции вы узнаете:
— как работает установка чтения ДНК (секвенатор);
— как реконструируется последовательность генома;
— как Леонард Эйлер помог современной биологии;
— почему суперкомпьютеры, спроектированные для физических расчетов, не подходят для современной биологии;
— что делать с последовательностью генома после реконструкции.

"Архэ" в ВК: vk.com/kpc_arhe
"Архэ" на ФБ: facebook.com/arhecenter
"Архэ" в Instagram: instagram.com